A flexible and reproducible pipeline for long-read assembly and evaluation
نویسندگان
چکیده
A recommendation of: Julie Orjuela, Aurore Comte, Sébastien Ravel, Florian Charriat, Tram Vi, Francois Sabot, Cunnac CulebrONT: a streamlined long reads multi-assembler pipeline for prokaryotic and eukaryotic genomes https://doi.org/10.1101/2021.07.19.452922
منابع مشابه
designing and validating a textbook evaluation questionnaire for reading comprehension ii and exploring its relationship with achievement
در هر برنامه آموزشی، مهم ترین فاکتور موثر بر موفقیت دانش آموزان کتاب درسی است (مک دونو و شاو 2003). در حقیقت ، کتاب قلب آموزش زبان انگلیسی است( شلدن 1988). به دلیل اهمیت والای کتاب به عنوان عنصر ضروری کلاس های آموزش زبان ، کتب باید به دقت ارزیابی و انتخاب شده تا از هرگونه تاثیر منفی بر دانش آموزان جلوگیری شود( لیتز). این تحقیق با طراحی پرسش نامه ارزیابی کتاب که فرصت ارزیابی معتبر را به اساتید د...
15 صفحه اولpassivity in waiting for godot and endgame: a psychoanalytic reading
this study intends to investigate samuel beckett’s waiting for godot and endgame under the lacanian psychoanalysis. it begins by explaining the most important concepts of lacanian psychoanalysis. the beckettian characters are studied regarding their state of unconscious, and not the state of consciousness as is common in most beckett studies. according to lacan, language plays the sole role in ...
Clustering of Short Read Sequences for de novo Transcriptome Assembly
Given the importance of transcriptome analysis in various biological studies and considering thevast amount of whole transcriptome sequencing data, it seems necessary to develop analgorithm to assemble transcriptome data. In this study we propose an algorithm fortranscriptome assembly in the absence of a reference genome. First, the contiguous sequencesare generated using de Bruijn graph with d...
متن کاملGenome assembly from synthetic long read clouds
MOTIVATION Despite rapid progress in sequencing technology, assembling de novo the genomes of new species as well as reconstructing complex metagenomes remains major technological challenges. New synthetic long read (SLR) technologies promise significant advances towards these goals; however, their applicability is limited by high sequencing requirements and the inability of current assembly pa...
متن کاملthe innovation of a statistical model to estimate dependable rainfall (dr) and develop it for determination and classification of drought and wet years of iran
آب حاصل از بارش منبع تأمین نیازهای بی شمار جانداران به ویژه انسان است و هرگونه کاهش در کم و کیف آن مستقیماً حیات موجودات زنده را تحت تأثیر منفی قرار می دهد. نوسان سال به سال بارش از ویژگی های اساسی و بسیار مهم بارش های سالانه ایران محسوب می شود که آثار زیان بار آن در تمام عرصه های اقتصادی، اجتماعی و حتی سیاسی- امنیتی به نحوی منعکس می شود. چون میزان آب ناشی از بارش یکی از مولفه های اصلی برنامه ...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Peer community in genomics
سال: 2022
ISSN: ['2780-0539']
DOI: https://doi.org/10.24072/pci.genomics.100018